類風濕關節炎、系統性紅斑狼瘡、硬皮病、系統性硬化症都是較為常見的結締組織疾病，與機體免疫功能的紊亂有關，可以累及全身各個系統。人們很早就注意到，在這些疾病的患者中，睡眠呼吸暫停綜合征的發生率較高。二者合併存在的機會較大，已經有證據表明，結締組織疾病患者中，存在著某些睡眠呼吸暫停綜合征的易患因素：
‧許多結締組織疾病患者長期服用強的松等激素類製劑，易引起水腫、脂肪的沈積和重新分佈，使頭面部、軀幹部脂肪量明顯增加，形成典型的水牛背、滿月臉表現。
‧結締組織疾患可以損害肌肉的結構及功能，引起上呼吸道肌肉群功能的改變，導致其他呼吸肌力量的減弱。
‧類風濕關節炎可引起下頜關節炎，導致下頜骨活動異常，加重或誘發呼吸暫停。膈神經是支配機體的主要呼吸肌肉--膈肌的神經，它的放電活動可以引起膈肌收縮，產生呼吸運動，系統性紅斑狼瘡可以損傷脂肌，影響呼吸功能。系統性硬化症常累及食管，在睡眠時，這類患者的胃內容物很容易反流到咽喉部氣管肉，引起反射性呼吸暫停、嗆咳。
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